Nexus 7にパズドラ（パズル＆ドラゴンズ）入れて遊んで見たんですが、その後root化したらパズドラが動かなくなってしまった。
どうも、
/system/app/Superuser.apk
/system/xbin/su
この２つがあるとだめなようで、/system/app/Superuser.apkは、
/data/app/Superuser.apkに移動して、/system/xbin/suはとりあえず、suuにrenameして、
動作するようになった。
＊書き換えメモ：/system フォルダを書き込み可能にする
$ adb shell
$ su
# mount -o rw,remount -t yaffs2 /dev/block/mtdblock3 /system